Суюк biopsies кан эмес, шишик ткань үчүн рагын аныктоочу колдонуу
Адатта, шишик ткань biopsies колдонуу каралат. Чакан үлгү шишиктен анализге алынып, genotyped, же генетикалык түзүлүшүбүздүн анализи. Бул ыкманын менен көйгөй biopsying шишиктер кыйын болушу мүмкүн эмес. Мындан тышкары, шишик биопсиясы шишиктин гана чагылдырып берет.
2015-жылы Discovery дары жазып, Labgaa жана биргелешип Жазуучулар кадимки шишик биопсиясы жөнүндө төмөнкүлөр негиз болот:
айкын себептерден улам, ал ырааттуу biopsies аркылуу шишик өнүгүшүн байкоо жүргүзүү кыйла оор. Ошондой эле, биопсиясы гана шишиктин бир так чагылдырат, ошондуктан чоң шишиктер менен соматикалык мутант караштардын бүтүндөй диапазонун чагылдырган күмөн. Башка бир шишик үчүн бир нече biopsies алууга болмок, бирок, бул параметр реалдуу да так эмес көрүнөт.
Суюк биопсиясы рак менен ооруган алынган кан үлгүлөрү менен ДНКны (ctDNA) жана башка шишик азыктары жүгүртүүдөгү өлчөйм билдирет. Бул өнүгүп келе жаткан диагностикалык мамиле тез арада, нейрохирургия жана экономикалык натыйжалуу болорун убадалайт.
Суюк биопсия тарыхы
1948-жылы, Mandel жана Métais, French изилдөөчүлөр бир жуп биринчи дени сак адамдардын канына ctDNA аныкталган. Бул ачылыш мурун эле жазылган болчу, жана аны андан ары ctDNA чалгындалган деп кийин он жылга чейин болгон эмес.
1977-жылы, Леон жана кесиптештери биринчи жолу рак менен ооругандардын канын ctDNA жогорулашы өлчөмү аныкталды.
1989-жылга чейин, Stroun жана кесиптештер рак (башкача айтканда, рак) кан мүнөздөмөлөрдүн аныкталган. Бул ачылыштар кийин, бир нече башка топтор ctDNA шишиктер менен жүгүртүүгө чыгарылган экенин далилдеген конкреттүү шишик suppressors жана oncogenes, microsatellite туруксуздук жана ДНК methylation менен пайда, аныкталган.
биз канга ctDNA шишик клеткалары ШКУнун алынган экенин билишет да, алардын келип чыгышын, бошотуу боюнча чен, бул ДНК чыгаруу механизмдерин изилдөө-бирине карама-каршы натыйжа берген менен, белгисиз. Кээ бир изилдөөлөр дагы зыяндуу шишиктери көбүрөөк өлгөн рак клеткаларын камтыйт жана ctDNA коё деп божомолдоого болот. Бирок, кээ бир изилдөөлөр бардык клеткалар ctDNA бошотуп деп божомолдоого болот. Ошентсе да, бул рак шишиктери ctDNA рак жакшы biomarker даярдоо, канга ctDNA көлөмүн көбөйгөн чыгарууну деп божомолдоого болот.
Анткени оор бөлүнгүс жана каны аз топтолушунун, ctDNA обочолонуп, талдоо үчүн кыйынга турат. кан жана плазма үлгүлөрүн ортосунда ctDNA топтолушунун айырмачылыктар бар. Ал кан плазмасын караганда кан кан эмес, ctDNA бир жакшы булагы болуп көрүнөт. Umetani жана кесиптештер менен изилдөөдө, ctDNA шогырлануы уюу жана башка белоктор үлгүлөрү даярдоонун жүрүшүндө алынып жатат деп, тазалоо учурунда ДНКны жүгүртүүдөгү улам мүмкүн жоготууга кан салыштырганда плазмада ырааттуу төмөн деп табылган.
Heitzer жана кесиптештеринин айтымында, бул жерде ctDNA жана диагностикалык мүмкүнчүлүктөрүн пайдалануу үчүн чечилиши керек болгон конкреттүү маселелер:
Биринчиден, preanalytical жол стандартташтырылган керек .... жогорку сапаттагы ДНК жетиштүү өлчөмдө казып алууну камсыз өзүнчө обочолонуусу жана ыкмасын тандоо маанилүү болуп саналат жана ал кан тандоо жана кайра иштетүү preanalytical нерселер катуу ДНК түшүмүн таасир этиши мүмкүн экенин көрсөттү жатат .... Экинчиден, негизги маселелердин бири сандык методдорду айкалыштыруу жоктугу болуп саналат. Бул өлчөө жалпы же amplifiable ДНК же максаттуу, анткени ар кандай сандык ыкмалары, ... ар кандай натыйжаларды чыгара .... Үчүнчүдөн, аз келип чыгышы жана ctDNA-релиздин толук механизми жөнүндө белгилүү болгон, ошондой эле ctDNA бошотуу салым кошо турган иш-чараларды бузуп көпчүлүк изилдөө.
Максаттуу болбогон мамилелер vs.
Учурда, ctDNA үчүн плазманын (же кан) анализдеп жатканда алынган эки негизги көз караштар бар. Биринчи ыкма максаттуу жана шишиктерди көрсөтүүдө өзгөчө генетикалык өзгөрүүлөрдүн издейт. Экинчи ыкма болбогон жана рак чагылдырат ctDNA издеп бир гендик-кең талдоолорду камтыйт. Же болбосо, ExoME тизмек бир кыйла үнөмдүү, болбогон мамиле катары колдонулуп жатат. Exomes белок үчүн копияланат ДНК бөлүктөрү болуп саналат.
даректүү мамилелер менен, кан айдоочусу мутант чакан топтому белгилүү генетикалык мутант үчүн жасалат.
Айдоочу болбосо жайылтуу, же "кууп", рак клеткаларынын өсүшүн геномдогу мутант билдирет. Булар болбосо Красная же EGFR кирет.
Анткени акыркы жылдары технологиялык өнүгүүлөр болгон, ctDNA аз өлчөмдөрдө ишке аша турган болуп калдым генетикалык талдоо ыкмаларын багытталган. Бул технологиялар курал-жарак кирет (ампер отко чыдамдуу түрлөрдүн системасы); санарип ПКО (dPCR); мончок, emulsions, нуска жана magnetics (курч); жана терең бир тизмек (CAPP-п).
максаттуу мамиле мүмкүн болгон технология бар ийгиликтер да, максаттуу мамиле гана болбосо (очогу) бир нече кызматтарды багытталган жана шишик басып туруучу гендер эле айдоочу мутант көп мүдүрүлөт.
суюк биопсиясы менен болбогон ыкмалардын негизги пайдасы улам сыноо нече генетикалык өзгөрүүлөргө муктаж эмес экенин бардык бейтаптарга пайдаланылышы мүмкүн эмес. Күндөлүк генетикалык бардык рак камтыйт жана конкреттүү рак колтамгасын эмес болуп жатат. Ошентсе да, мындай мамиле аналитикалык сезгичтиги жана шишик геномунун комплекстүү талдоо азырынча мүмкүн эмес, жок.
Белгилей кетчү жагдай, бүтүндөй геномун баасы кыйла кыскара түштү. 2006-жылы, бүт геномун баасы болжол менен $ 300,000 (АКШ) болгон. 2017-жылга карата, наркы, анын ичинде химиялык реагенттер, тизмек машиналардын кг, болжол менен $ 1000 (USD) генетикалык пайызга чейин тёмёндёгён.
Суюк биопсия клиникалык пайдалуу
ctDNA колдонуу үчүн жасалган иш-аракеттерден рак менен ооруган адамдарга же пайдалуу оору менен ооруган адамдар менен дени сак оорулууларда диагностикалык жана салыштырмалуу жогорку эле. бул аракеттердин кээ бир жыйынтыктары рак, оору-эркин статусуна же эмделип көрсөтүү олуттуу айырмачылыктарды көрсөтүү гана изилдөө менен аралашып кеткен эле.
ctDNA рагын аныктоочу бир гана жолу бир колдонсо болот себеби ctDNA бир өзгөрмөлүү суммалар шишиктер алынган, себеби болуп саналат. Бардык эле баш шишигине окшош бирдей өлчөмдө ДНК "төккөн". Жалпысынан алганда, өнүккөн, кеңири таралган шишиктердин эрте, жергиликтүү, шишиктери караганда жүгүртүүгө көбүрөөк ДНК төгүлгөн. Мындан тышкары, ар кандай шишик түрлөрү жүгүртүүгө ДНКнын башка суммаларды төккөн. шишик алынган ДНКны жүгүртүүдөгү үлүшү 0,01% дан 93% га чейинки изилдөөлөрдүн жана рак түрлөрү боюнча көп өзгөрүлмөлүү болуп саналат. Бул, жалпысынан алганда, ctDNA аз эле шишиктин, кадимки кыртыштардын келе калган алынган экенин белгилей кетүү маанилүү.
Таратылган ДНК оорунун этээрин бла катары колдонулушу мүмкүн. Таратылган ДНК убакыттын өтүшү менен рак өзгөртүүлөрдү мониторинг жүргүзүү үчүн колдонулушу мүмкүн. Мисалы, бир изилдөөгө ылайык, эки жыл жашап кочуштап рак менен ооруган бейтаптарды чен көрсөткөн (б.а., кочуштап рак менен диагноз коюлгандан кийин тирүү, жок эле дегенде, эки жыл бейтаптардын саны) жана далил жок адамдардын Красная түйүнү мутант 100 пайыз болгон жүгүртүүдөгү ДНКны тиешелүү. Мындан тышкары, жакынкы келечекте, жүгүртүүдөгү ДНК precancerous келишимдер мониторинг жүргүзүү үчүн колдонулушу мүмкүн деп божомолдоого болот.
Таратылган ДНК да дарылоого жооп мониторинг жүргүзүү үчүн колдонулушу мүмкүн. жүгүртүүдөгү ДНК шишиктерди генетикалык түзүлүшүбүздүн жакшы жалпы сүрөттү proffers болгондуктан, бул ДНК, кыязы, ордуна шишиктер өздөрү чейин жеткен диагностикалык ДНКнын пайдаланылышы мүмкүн диагностикалык ДНКны, камтыйт.
Эми суюк анализимдин айрым мисалдарды карап көрөлү.
Guardant360
Guardant Health 73 рак байланыштуу гендер мутант жана хромосомдук бошотуулар боюнча жүгүртүүдөгү ДНКны Перейти кийинки муундагы тизмектин колдонот сыноого иштелип чыккан. Guardant Саламаттык онкология суюктук биопсиясы берүүнүн отчет изилдөө жарыяланды. изилдөө биргелешкен 50 шишик түрлөрү менен ооруган 15,000 кан үлгүлөрүн колдонулат.
басымдуу бөлүгү, суюк биопсиясы сыноо натыйжасында шишик biopsies байкалган ген өзгөртүүлөргө ылайык келтирилиши керек.
Жүргүзүлгөн изилдөө иштерине ылайык:
Guardant360 эле EGFR сыяктуу маанилүү рак байланыштуу ген сын пайда, BRAF, Красная, жана PIK3CA шишик биопсиясы үлгүлөрдү эмне мурда аныкталган окшош толкун статистикалык 94% 99% га чейин келүүчү аныкталган.
Андан тышкары, изилдөө боюнча окумуштуулар төмөнкүдөй билдирди:
Изилдөөнүн экинчи компоненти боюнча, изилдөөчүлөр 400гө жакын бейтаптарды-көпчүлүк өпкөнүн же кочуштап рак да кан болгон эле ким ctDNA жана шишик ткань ДНК натыйжалары жана геномдук өзгөрүүлөрдүн моделдерин салыштырмалуу баа. шишик биопсиясы анализдер чыккан жыйынтыктары менен салыштырмалуу суюк биопсиясы жалпы тактыгы 87% ды түзгөн. кан жана шишик үлгүлөрү бири-бирине 6 айдын ичинде чогултулган кийин тактыгы 98% га чейин өстү.
Guardant360 кандагы ДНКны жүгүртүүдөгү сапаты төмөн болсо да так эле. Көп учурда, жүгүртүү шишик ДНК гана кан ДНК 0,4 пайызды тъзгён.
Жалпысынан, суюк биопсия колдонуп, Guardant изилдөөчүлөр менен ооругандардын 67 пайыз дарыгерлер менен дарылоо керектигин шишик белгилерин аныктап алдык. Мындай оорулуулар FDA бекитилген дарылоонун, ошондой эле тергөө ыкмалар жарамдуу болгон.
ctDNA жана Lung Cancer
2016-жылы, FDA EGFR Mutation Test cobas өпкө рагы менен ооругандардын жүгүртүүдөгү ДНКдагы EGFR мутант аныктоо үчүн пайдаланылышы үчүн бекитилген. Бул сыноо биринчи FDA бекитилген суюк биопсиясы жана erlotinib аркылуу максаттуу ыкмалар менен дарылоо үчүн талапкер болушу мүмкүн бейтаптар аныкталган (Tarceva) болгон, afatinib (Gilotrif), жана gefitinib (Iressa) дарылоодо биринчи кезекте сойломо жана osimeritinib (Tagrisso) катары экинчи катардагы дарылоо. Бул максаттуу дарылоо белгилүү EGFR мутант менен рак клеткаларга кол салган.
Маанилүүсү, анткени жалган-терс жыйынтыгы жогорку санынын, кутунун бир кыртыштын биопсиясы үлгү, ошондой эле терс суюк биопсиядан бар бейтаптын алынып сунуштайт.
ctDNA жана боор рагы
Боор рагынын өлүмгө кабылган адамдардын саны акыркы 20 жыл ичинде көбөйүп келет. Учурда, боор рагы дүйнөдө рак өлүм экинчи себеби болуп саналат. аныктоо жана боорду, же hepatocellular (Коламбии), рак талдоо үчүн жеткиликтүү жакшы Эпке жок. ДНКны Таратылган боордун рагынын жакшы biomarker болушу мүмкүн.
Боор рагын аныктоочу үчүн жүгүртүүдөгү ДНКны колдонуу мүмкүнчүлүктөрү жөнүндө Lagbaa төмөнкү сунушту жана биргелешип жазуучулар карап көрөлү:
RASSF1A, 15-бет, жана Б16 менен Hypermethylation 50 Коламбии бейтаптарды, анын ичинде бир мүнөз изилдөө менен эрте диагностикалык куралы катары сунуш кылынды. төрт aberrantly methylated ген бир колу (АТК, GSTP1, RASSF1A жана SFRP1) RASSF1A боюнча methylation бир этээрин biomarker деп билдирди, ал эми ошондой эле дартты так сыналган. Кийинки изилдөөлөр Коламбии бейтаптарды кетчү нерсе, бузук ДНК көчүрмөсү саны кан чогултуу учурунда Коламбии мурдагы тарыхта жок эки гепатити менен аныкталган терең бир тизмек технологияларын .... колдонуп ctDNA талдап, бирок андан учурунда Коламбии иштеп чыккандар. Бул ачылыш эрте Коламбии аныктоо үчүн көчүрмөсү саны тандоо куралы катары ctDNA ар түрдүү баа берүү үчүн эшигин ачты.
Сөзү
Суюк biopsies геномдук диагноздоо үчүн кызыктуу жаңы ыкма болуп саналат. Учурда, ар тараптуу молекулярдык маалыматтардын сунуш бир суюк биопсиясынын, кыртыш биопсиясы алынган генетикалык маалыматты толуктап дарыгерлерге чейин бар. Ошондой эле, кыртыш биопсиясы-кыртыш biopsies жеткиликтүү эмес ордуна колдонсо болот бир суюк biopsies бар.
Бул көп суюктук биопсиясы сыноолор учурда уланып экенин эстен чыгарбаганыбыз маанилүү жана изилдөө бул аралашуу терапиялык арналышты ишке дене болушу үчүн эмне кылыш керек.
> Булак:
> Шишиктеринде генетикалык өзгөрүүлөр үчүн кан Test КЕСҮҮ деп рака биопсия убадасы көрсөтөт. Кадам.
> Heitzer E, Ulz P, Geigl JB. Рак оорусу үчүн суюк биопсия катары рака ДНК Таратылган. Клиникалык химия. 2015; 61: 112-123. чтыкта: 10,1373 / clinchem.2014.222679
> Lagbaa J, Villanueva А. суюк биопсиясы боор рагы менен. Discovery Medicine. 2015; 19 (105): 263-73.
> Суюк биопсия: Кан менен ДНКны колдонуу аныктоо, Track жана Рак мамиле кылышыбыз керек. Кадам.
> Umetani N, .Удаалаш. Плазма караганда кан эркин жүгүртүүдөгү ДНК жогорку өлчөмү негизинен бөлүнүү учурунда булганган бөтөн ДНК менен шартталган эмес. Ann NY Акад Sci. 2006-жылдын, 1075: 299-307.
> Залалдуу Pharmacotherapy жылы Wellstein А. Жалпы жоболор. Жылы: Brunton LL, Хилал-Дандан R, Knollmann BC. Медиада. Гудман & Гилман анын: Therapeutics жана дары-дармек менен негиз 13e New York, NY: McGraw-Хилл.